29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4483 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  92.62 
 
 		 918 bp  908    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4483    100 
 
 		 654 bp  1296    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000465476  unclonable  0.00000109181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  86.56 
 
 		 924 bp  280  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0323  DNA-3-methyladenine glycosylase II  80.28 
 
 		 1032 bp  220  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0086  DNA-3-methyladenine glycosylase II  80.04 
 
 		 1032 bp  208  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00010571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2324  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  79.75 
 
 		 942 bp  196  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2301  DNA-3-methyladenine glycosylase II  79.75 
 
 		 942 bp  196  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0116  DNA-3-methyladenine glycosylase II  79.75 
 
 		 897 bp  196  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00108548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2250  DNA-3-methyladenine glycosylase II  79.75 
 
 		 942 bp  196  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00101826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2835  DNA-3-methyladenine glycosylase II  79.75 
 
 		 915 bp  196  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0133  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  84.75 
 
 		 915 bp  172  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0117  DNA-3-methyladenine glycosylase II  84.75 
 
 		 942 bp  172  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000127704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  84.43 
 
 		 960 bp  167  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  84.43 
 
 		 960 bp  167  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  84.02 
 
 		 960 bp  159  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3088  alcohol dehydrogenase  83.9 
 
 		 975 bp  151  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  hitchhiker  0.000862712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3204  alcohol dehydrogenase  83.54 
 
 		 975 bp  145  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  86.71 
 
 		 960 bp  133  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3144  alcohol dehydrogenase  80.14 
 
 		 972 bp  117  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000700738  unclonable  0.00000000000553722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1072  transcriptional regulator, AraC family  92.73 
 
 		 1584 bp  77.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1032  transcriptional regulator, AraC family  83.33 
 
 		 1542 bp  67.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1029  transcriptional regulator, AraC family  83.33 
 
 		 1542 bp  67.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0970  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  95 
 
 		 1545 bp  63.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  91.49 
 
 		 894 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3550  alcohol dehydrogenase  87.76 
 
 		 1458 bp  50.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4325  HhH-GPD family protein  96.55 
 
 		 888 bp  50.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280945  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  83.12 
 
 		 1461 bp  50.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3726  transcriptional regulator, AraC family  88.89 
 
 		 1605 bp  50.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  96.55 
 
 		 894 bp  50.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>