123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4480 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4480  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  376  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000179703  unclonable  0.00000143245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3957  YaeQ family protein  98.37 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000199696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3090  YaeQ family protein  89.39 
 
 		 213 aa  333  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  hitchhiker  0.0000000000000632284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6510  YaeQ family protein  79.35 
 
 		 184 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000951351  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0113  hypothetical protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0319  YaeQ protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2838  hypothetical protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205876  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2247  hypothetical protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000660354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0114  hypothetical protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000118286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0130  hypothetical protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000524498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2298  YaeQ family protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000242525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2321  hypothetical protein  81.52 
 
 		 184 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000528639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0083  YaeQ family protein  80.98 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000751085  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3091  YaeQ family protein  79.89 
 
 		 184 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000165953  hitchhiker  0.00193628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3207  YaeQ family protein  79.35 
 
 		 207 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000622432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3147  YaeQ family protein  78.8 
 
 		 184 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000290588  hitchhiker  0.000000000113201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2541  YaeQ  78.26 
 
 		 184 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000013514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3154  YaeQ family protein  78.26 
 
 		 184 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000739819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3173  YaeQ family protein  78.26 
 
 		 184 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565771  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0785  hypothetical protein  56.11 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.275358  normal  0.164978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0731  YaeQ family protein  57.07 
 
 		 183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0801  YaeQ family protein  56.52 
 
 		 183 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0716  YaeQ family protein  60.61 
 
 		 182 aa  213  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1677  YaeQ family protein  63.12 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188991  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1131  YaeQ family protein  58.79 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.892048  normal  0.144785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0160  YaeQ  58.9 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0680  hypothetical protein  54.7 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149078  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1059  hypothetical protein  54.95 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0446  YaeQ family protein  56.89 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3857  YaeQ family protein  54.24 
 
 		 184 aa  197  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1792  YaeQ  55.25 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3107  hypothetical protein  51.4 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2885  YaeQ family protein  51.96 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120189  hitchhiker  0.000000102094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00913  YaeQ  47.67 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1389  YaeQ family protein  51.4 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0116902  hitchhiker  0.0000000350143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1454  YaeQ family protein  51.4 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0751481  hitchhiker  0.000381127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1442  YaeQ family protein  51.4 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000463283  hitchhiker  0.000000191661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2478  YaeQ family protein  50.28 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000591787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0813  hypothetical protein  49.16 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2780  YaeQ family protein  50.28 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2800  YaeQ family protein  50.28 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00447906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1577  YaeQ family protein  50.28 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232242  hitchhiker  0.0000000100373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2875  YaeQ family protein  50.28 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0441  hypothetical protein  51.37 
 
 		 186 aa  187  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.249017  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1763  YaeQ family protein  50.28 
 
 		 179 aa  188  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00551607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1408  YaeQ  48.89 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1477  YaeQ family protein  48.89 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2694  YaeQ family protein  49.72 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2331  YaeQ family protein  50 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.234988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0216  YaeQ family protein  50.3 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3468  YaeQ  50.56 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1268  YaeQ family protein  51.12 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1622  YaeQ family protein  56.44 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00401  YaeQ family protein  52.41 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.967913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3761  YaeQ family protein  49.1 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3377  YaeQ family protein  51.15 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4027  YaeQ family protein  51.15 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2468  YaeQ family protein  50 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0854  YaeQ family protein  49.43 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0261  hypothetical protein  46.7 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0280  hypothetical protein  46.7 
 
 		 181 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0261  hypothetical protein  46.7 
 
 		 181 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  normal  0.829683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0277  hypothetical protein  46.7 
 
 		 181 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.908586  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1157  YaeQ family protein  48.86 
 
 		 186 aa  174  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0729  YaeQ family protein  46.7 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0266  hypothetical protein  46.7 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.135669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0193  hypothetical protein  45.6 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0202  hypothetical protein  46.15 
 
 		 181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0201  hypothetical protein  45.6 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3339  YaeQ family protein  44.75 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00189  hypothetical protein  45.6 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3412  YaeQ family protein  45.6 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00188  hypothetical protein  45.6 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3469  YaeQ family protein  45.6 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0184  hypothetical protein  45.6 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0828  YaeQ  55.83 
 
 		 182 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0277773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0962  YaeQ family protein  44.75 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.505382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4670  YaeQ family protein  49.14 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2959  YaeQ family protein  48.78 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0195  hypothetical protein  45.05 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4048  YaeQ  45.9 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5170  YaeQ family protein  48 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1035  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3413  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1088  YaeQ family protein  46.15 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.39244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3144  YaeQ family protein  47.56 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2189  hypothetical protein  41.34 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2272  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000919278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3227  YaeQ family protein  40.34 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994476  normal  0.0845748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1262  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3382  YaeQ family protein  41.24 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2186  hypothetical protein  37.93 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644819  decreased coverage  0.00295467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1476  YaeQ family protein  38.76 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4245  YaeQ family protein  38.76 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1081  YaeQ family protein  38.76 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1545  initiation factor 3  39.11 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2602  YaeQ  39.76 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2646  YaeQ family protein  39.76 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3118  YaeQ  39.05 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2925  YaeQ family protein  37.71 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.157625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>