176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4431 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  53.1 
 
 
626 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  53.15 
 
 
633 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  60.16 
 
 
626 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  71.27 
 
 
629 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  69.37 
 
 
629 aa  895    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  77.78 
 
 
629 aa  1004    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  59.08 
 
 
626 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  71.27 
 
 
629 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  53.1 
 
 
626 aa  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  54.52 
 
 
628 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  69.63 
 
 
629 aa  914    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  57.1 
 
 
639 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  63.75 
 
 
626 aa  840    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  59.27 
 
 
626 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  53.1 
 
 
626 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1291    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  66.03 
 
 
629 aa  851    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  71.22 
 
 
629 aa  932    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  71.27 
 
 
629 aa  917    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  59.94 
 
 
627 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  71.27 
 
 
629 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  59.78 
 
 
627 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  59.08 
 
 
626 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  71.43 
 
 
629 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  57.62 
 
 
654 aa  727    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  51.82 
 
 
637 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  59.62 
 
 
627 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  59.08 
 
 
626 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  71.43 
 
 
629 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  59.87 
 
 
626 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  71.27 
 
 
629 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  70.11 
 
 
629 aa  911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  51.5 
 
 
642 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  46.73 
 
 
623 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  46.58 
 
 
623 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  46.42 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  46.42 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  46.42 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  46.42 
 
 
623 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  46.42 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  46.42 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  46.26 
 
 
623 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  45.11 
 
 
628 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  44.27 
 
 
623 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  44.22 
 
 
620 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  42.97 
 
 
624 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  42.11 
 
 
624 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  42.7 
 
 
619 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  42.7 
 
 
619 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  43.01 
 
 
641 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  41.68 
 
 
624 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  42.31 
 
 
619 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.49 
 
 
630 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  37.76 
 
 
625 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  38.91 
 
 
638 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.17 
 
 
605 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.33 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.16 
 
 
652 aa  294  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  33.88 
 
 
589 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.82 
 
 
612 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  32.33 
 
 
611 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  32.17 
 
 
611 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  32.17 
 
 
611 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  30.65 
 
 
611 aa  265  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  31.86 
 
 
612 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  31.86 
 
 
612 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  32.17 
 
 
611 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  32.17 
 
 
611 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  32.17 
 
 
611 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  31.7 
 
 
612 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  31.7 
 
 
612 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.7 
 
 
612 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.14 
 
 
590 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.6 
 
 
590 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  31.14 
 
 
612 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  33.33 
 
 
621 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  31.7 
 
 
611 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  30.24 
 
 
589 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.28 
 
 
593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  31.09 
 
 
610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  33.49 
 
 
621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  30.19 
 
 
606 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  31.55 
 
 
611 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  30.69 
 
 
616 aa  244  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  29.72 
 
 
606 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  32.06 
 
 
586 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  31.48 
 
 
597 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  29.62 
 
 
606 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.03 
 
 
607 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  31.02 
 
 
620 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  29.94 
 
 
606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  30.1 
 
 
597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  28.14 
 
 
609 aa  240  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  29.98 
 
 
597 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.13 
 
 
588 aa  230  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.86 
 
 
588 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  28.85 
 
 
610 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  29.42 
 
 
588 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  30.52 
 
 
587 aa  223  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.86 
 
 
588 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>