40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4428 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  29.74 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  27.74 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  26.35 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  43.12 
 
 		 192 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  26.12 
 
 		 383 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  27.32 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  26.89 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  26.9 
 
 		 370 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  28.73 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  27.08 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  25.22 
 
 		 348 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  26.88 
 
 		 357 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  25.85 
 
 		 356 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  26.32 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  25.84 
 
 		 340 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  25.53 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  23.44 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  27.84 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  30.62 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  25.21 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  42.53 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  27.32 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  32.52 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  32.26 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 825 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 		 949 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  28.86 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  23.24 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.43 
 
 		 886 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 881 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  24.16 
 
 		 846 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  24.35 
 
 		 976 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 866 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>