More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4377 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  98.62 
 
 		 362 aa  634    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  89.53 
 
 		 362 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  83.06 
 
 		 359 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  83.98 
 
 		 395 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  84.44 
 
 		 387 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  83.7 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  83.7 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  83.33 
 
 		 359 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  83.33 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 		 357 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  70.44 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  67.68 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  65.84 
 
 		 351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  65.32 
 
 		 384 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  70.72 
 
 		 359 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  68.48 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  68.78 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  63.64 
 
 		 350 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  65.19 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  62.53 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  64.56 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  63.91 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  61.35 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  61.33 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  62.94 
 
 		 369 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  61.33 
 
 		 352 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  62.77 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  60.06 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  50.97 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  44.01 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  42.9 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  43.37 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  43.18 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  42.3 
 
 		 323 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.9 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  42.18 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.55 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.33 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  41.9 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.44 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  41.27 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  40.72 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  41.55 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.67 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  40.9 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.34 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.06 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  40.72 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  40.33 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.4 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.85 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.4 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.4 
 
 		 316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  38.95 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.85 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.85 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.85 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.4 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  41.19 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  38.4 
 
 		 320 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  38.12 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  40.73 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  38.23 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  39.72 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.05 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  40.97 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  38.4 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  39.34 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  38.4 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  40.95 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.57 
 
 		 332 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  41.26 
 
 		 364 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  40.5 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  40.56 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  40.28 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  39.08 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  38.24 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  39.17 
 
 		 355 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  35.86 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  36 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  38.66 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  38.7 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  38.7 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  36.22 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  38.66 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  38.42 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  38.7 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>