More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4307 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.46 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 209 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  65.15 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  40.68 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  56.41 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
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NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 74 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  52.56 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
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NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  45.54 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  48.53 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.5 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
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NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
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NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  29.85 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
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NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
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NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
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