More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4300 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  64.02 
 
 		 190 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  30.11 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.98 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  26.84 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
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NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
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