More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4240 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  92.37 
 
 		 356 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 359 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  96.05 
 
 		 356 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  90.09 
 
 		 355 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  90.8 
 
 		 372 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  90.09 
 
 		 355 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  90.09 
 
 		 355 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  90.24 
 
 		 355 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  90.24 
 
 		 355 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  88.86 
 
 		 367 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  88.76 
 
 		 359 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  88.76 
 
 		 359 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  88.76 
 
 		 359 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  88.76 
 
 		 359 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  89.05 
 
 		 358 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  88.76 
 
 		 359 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  88.76 
 
 		 359 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  80.18 
 
 		 346 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  78.45 
 
 		 351 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  80.18 
 
 		 346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  79.88 
 
 		 355 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  80.72 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  78.96 
 
 		 354 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  78.89 
 
 		 354 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  78.25 
 
 		 366 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0102  homocysteine S-methyltransferase  77.64 
 
 		 344 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  77.34 
 
 		 351 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0460  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  76.81 
 
 		 348 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0172  methionine synthase (B12-dependent)  75.07 
 
 		 348 aa  534  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.727422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  75.37 
 
 		 348 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0166  methionine synthase (B12-dependent)  77.34 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  73.49 
 
 		 357 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1195  methionine synthase  74.93 
 
 		 370 aa  514  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  73.65 
 
 		 1262 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0169  homocysteine S-methyltransferase  71.26 
 
 		 368 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0174  methionine synthase (B12-dependent)  73.9 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.600189  hitchhiker  0.00922772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  63.94 
 
 		 1232 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  63.69 
 
 		 1251 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  64.6 
 
 		 1245 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  63.36 
 
 		 1267 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  63.03 
 
 		 1250 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  64.35 
 
 		 1236 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  63.29 
 
 		 1269 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  62.76 
 
 		 1235 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  62.12 
 
 		 1239 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  63.33 
 
 		 1234 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  62.76 
 
 		 1235 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  63.33 
 
 		 1234 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  63.44 
 
 		 1244 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  60.12 
 
 		 1243 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  61.52 
 
 		 1239 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  63.64 
 
 		 1232 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  62.24 
 
 		 1236 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  62.16 
 
 		 1235 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  62.12 
 
 		 1235 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  61.82 
 
 		 1237 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  59.48 
 
 		 1244 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  61.9 
 
 		 1264 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  62.73 
 
 		 1278 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  63.72 
 
 		 1271 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  62.88 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  61.47 
 
 		 1244 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  61.9 
 
 		 1264 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  60.55 
 
 		 1244 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  61.61 
 
 		 1251 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  60.55 
 
 		 1244 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  60.86 
 
 		 1244 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  60.3 
 
 		 1233 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  62.42 
 
 		 1227 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  63.8 
 
 		 1293 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  61.16 
 
 		 1244 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  61.47 
 
 		 1244 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  60.92 
 
 		 1238 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  61.16 
 
 		 1244 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  62.11 
 
 		 1227 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  63.04 
 
 		 1263 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.74 
 
 		 1226 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  60.87 
 
 		 1230 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  62.97 
 
 		 1220 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  59.94 
 
 		 1245 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  59.09 
 
 		 1227 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  61.04 
 
 		 1226 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  61.61 
 
 		 1238 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  62.19 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  62.07 
 
 		 1241 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  63.49 
 
 		 1220 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  59.52 
 
 		 1232 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  60.06 
 
 		 1245 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  62.35 
 
 		 1237 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  61.66 
 
 		 1226 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  59.82 
 
 		 1227 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  59.1 
 
 		 1240 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  59.51 
 
 		 1230 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  60.37 
 
 		 1271 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  61.06 
 
 		 1247 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1228 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  59.51 
 
 		 1230 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  62.07 
 
 		 1228 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  59.51 
 
 		 1231 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  60.5 
 
 		 1228 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>