More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4097 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  91.52 
 
 		 389 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 389 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  59.09 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2512  OmpC family outer membrane porin  60.68 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.127699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.87 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  48.61 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  48.11 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  48.11 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  48.11 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  48.11 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  48.11 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  48.11 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  48.11 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  50.5 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  50.5 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  47.86 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  48.21 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.51 
 
 		 389 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  48.21 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  48.21 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  48.1 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  48.1 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.98 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.09 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  45.72 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  44.62 
 
 		 386 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  47.27 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  45.34 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.46 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  47.16 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  44.67 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  44.96 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  45.02 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  40.9 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  47.51 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  42.93 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  44.09 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  42.67 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  43.41 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  41.54 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.4 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  41.98 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  40.41 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.16 
 
 		 414 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.25 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.05 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.05 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  40.82 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  41.54 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  39.56 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.04 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.45 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.29 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.04 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.1 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  41.58 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  39.66 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.19 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  41.83 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  40.9 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  41.19 
 
 		 409 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  41.19 
 
 		 409 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40.1 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.35 
 
 		 383 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  42.19 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.19 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.8 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.19 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.9 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.19 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  40.87 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  41.09 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  43.1 
 
 		 352 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  39.81 
 
 		 412 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  40.45 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  39.66 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  41.65 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  40.29 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  40.64 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  40.46 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  40.64 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  38.77 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  42.14 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  38.77 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.81 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  38.77 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  42.5 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  38.77 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  41.2 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  38.42 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  38.79 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  38.79 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>