More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4088 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  344  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  98.19 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  61.78 
 
 
172 aa  209  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  61.78 
 
 
172 aa  209  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  61.94 
 
 
172 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  57.52 
 
 
175 aa  190  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  57.52 
 
 
175 aa  190  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  57.14 
 
 
216 aa  190  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  56.21 
 
 
175 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  54.14 
 
 
174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  55.19 
 
 
175 aa  187  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  54.14 
 
 
174 aa  186  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  54.61 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  54.61 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  54.61 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  57.43 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  57.89 
 
 
173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  56.76 
 
 
168 aa  176  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  53.29 
 
 
175 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  60 
 
 
172 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  57.93 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  52.29 
 
 
171 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  52.32 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0462  dehydratase  53.47 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.244814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3023  dehydratase  51.75 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4501  dehydratase  53.64 
 
 
169 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4032  dehydratase  51.92 
 
 
190 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962919  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2919  dehydratase  49.69 
 
 
184 aa  160  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  47.27 
 
 
174 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  52.03 
 
 
171 aa  158  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4264  MaoC domain protein dehydratase  49.67 
 
 
169 aa  157  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2168  MaoC-like dehydratase  50.99 
 
 
169 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.234418  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  49.06 
 
 
184 aa  157  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  48.72 
 
 
199 aa  155  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  51.75 
 
 
170 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  50.62 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  47.13 
 
 
164 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  46.79 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  46.79 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  46.79 
 
 
161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  52.08 
 
 
172 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  48.98 
 
 
177 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  49.66 
 
 
185 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1459  dehydratase  45.33 
 
 
177 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  47.33 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  45.91 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  45.06 
 
 
169 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  47.55 
 
 
165 aa  136  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  47.89 
 
 
168 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  44.83 
 
 
160 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  44.23 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  48.95 
 
 
176 aa  134  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  46.05 
 
 
159 aa  133  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  44.08 
 
 
186 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  46.26 
 
 
154 aa  131  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  45.89 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  43.84 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  46.9 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  46.58 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  44.52 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  43.15 
 
 
150 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  43.84 
 
 
150 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  45.45 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  46.58 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  42.18 
 
 
150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  39.19 
 
 
344 aa  124  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  43.36 
 
 
150 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  42.47 
 
 
150 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  43.71 
 
 
161 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  51.05 
 
 
161 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  41.96 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  41.78 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  42.67 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  41.61 
 
 
153 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  40.79 
 
 
155 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  41.1 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  39.04 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  40.41 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  39.38 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1582  dehydratase  35.22 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0997283  hitchhiker  0.00301397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0834  putative dehydratase  39.19 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0152637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  43.36 
 
 
348 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  35.66 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  36.73 
 
 
353 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3337  MaoC domain protein dehydratase  36.05 
 
 
384 aa  88.2  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  36.31 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  36.15 
 
 
160 aa  84.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  33.1 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  31.54 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  37.98 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  32 
 
 
348 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  39.1 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>