17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4081 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  538  1e-152  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  88.39 
 
 
266 aa  452  1e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  66.67 
 
 
267 aa  338  6e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  38.22 
 
 
252 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  33.59 
 
 
254 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  34.08 
 
 
254 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  32.21 
 
 
253 aa  135  6e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  31.05 
 
 
236 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  29.81 
 
 
261 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  31.2 
 
 
253 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  31.11 
 
 
253 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  32.59 
 
 
309 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  23.66 
 
 
261 aa  70.5  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  26.09 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  24.09 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>