298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4016 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  96.67 
 
 
300 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  77.33 
 
 
285 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  68.42 
 
 
295 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  67.66 
 
 
301 aa  407  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  68.77 
 
 
295 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  68.09 
 
 
295 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  68.09 
 
 
295 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  68.44 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  67.87 
 
 
303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  68.44 
 
 
292 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  68.44 
 
 
292 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  68.11 
 
 
292 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  68.44 
 
 
292 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  68.44 
 
 
292 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  68.44 
 
 
292 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  68.44 
 
 
292 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  75.51 
 
 
285 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  61.32 
 
 
292 aa  361  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  69.11 
 
 
288 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  59.4 
 
 
292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  59.87 
 
 
292 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  57.68 
 
 
286 aa  345  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  44.37 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
318 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  42.14 
 
 
340 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  42.04 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  46.12 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  46.41 
 
 
303 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  41.81 
 
 
306 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  41.81 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  45.87 
 
 
310 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  46.15 
 
 
314 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  44.14 
 
 
236 aa  178  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  42.62 
 
 
308 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  43.12 
 
 
218 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  39.82 
 
 
239 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  36.17 
 
 
244 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.73 
 
 
261 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  35.04 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  37.56 
 
 
242 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.3 
 
 
243 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
241 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.71 
 
 
262 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  37.88 
 
 
217 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  35.27 
 
 
260 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  34.82 
 
 
241 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  29.91 
 
 
240 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  35.27 
 
 
241 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  31.62 
 
 
242 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  37.02 
 
 
265 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.22 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  30.34 
 
 
240 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.98 
 
 
243 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  33.78 
 
 
224 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  30.34 
 
 
240 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  33.47 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  31.72 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  29.84 
 
 
252 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  27.71 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  30.4 
 
 
234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.31 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  29.03 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  32.73 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.57 
 
 
239 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  37.11 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  35.62 
 
 
233 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.68 
 
 
227 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  32.42 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  36.98 
 
 
244 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.8 
 
 
251 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.22 
 
 
227 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  34.57 
 
 
243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  30.36 
 
 
223 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  28.98 
 
 
251 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  28.45 
 
 
242 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  32.73 
 
 
246 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.26 
 
 
249 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  36.02 
 
 
247 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  28.81 
 
 
231 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  30.42 
 
 
245 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.09 
 
 
224 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.87 
 
 
223 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.92 
 
 
241 aa  105  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  31.68 
 
 
256 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.02 
 
 
224 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  33.93 
 
 
227 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.25 
 
 
235 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.79 
 
 
254 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  31.68 
 
 
278 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  29.05 
 
 
243 aa  102  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  32.64 
 
 
243 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  31.68 
 
 
249 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.63 
 
 
234 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.19 
 
 
270 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>