251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4006 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.64 
 
 		 478 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  81.19 
 
 		 486 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.1 
 
 		 484 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.22 
 
 		 484 aa  828    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.1 
 
 		 484 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.43 
 
 		 484 aa  831    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  80.12 
 
 		 489 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6083  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  78.72 
 
 		 490 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  79.26 
 
 		 488 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  78.07 
 
 		 491 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.64 
 
 		 478 aa  701    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2826  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  79.35 
 
 		 491 aa  741    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0309139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.15 
 
 		 476 aa  700    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  79.26 
 
 		 488 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  79.35 
 
 		 489 aa  766    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  89.88 
 
 		 483 aa  842    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  88.43 
 
 		 607 aa  831    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01840  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  72.52 
 
 		 477 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0883663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.05 
 
 		 477 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  81.6 
 
 		 486 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3788  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.64 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  89.67 
 
 		 484 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.64 
 
 		 484 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.08 
 
 		 475 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.22 
 
 		 484 aa  828    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4544  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  74.38 
 
 		 474 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  100 
 
 		 484 aa  958    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.22 
 
 		 484 aa  828    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.54 
 
 		 474 aa  678    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0338  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.55 
 
 		 474 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3571  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.62 
 
 		 473 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  79.59 
 
 		 490 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.44 
 
 		 478 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  89.67 
 
 		 484 aa  829    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  89.46 
 
 		 484 aa  814    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  98.14 
 
 		 484 aa  947    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  74.64 
 
 		 478 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.24 
 
 		 475 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  74.43 
 
 		 478 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3300  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.45 
 
 		 474 aa  659    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.43 
 
 		 484 aa  831    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  89.67 
 
 		 484 aa  829    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.14 
 
 		 487 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.26 
 
 		 478 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  81.84 
 
 		 486 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3798  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 		 474 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3951  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.24 
 
 		 474 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.22 
 
 		 484 aa  828    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4750  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.21 
 
 		 477 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  67.42 
 
 		 459 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  64.03 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  64.24 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  56.73 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.01 
 
 		 467 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  58.8 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.26 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.02 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.25 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.68 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.45 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.3 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  58.92 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1950  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.37 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0105538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.08 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.39 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.93 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.88 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  58.63 
 
 		 465 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.88 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  56.49 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.42 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.3 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.83 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.47 
 
 		 467 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.32 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.95 
 
 		 470 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.47 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.01 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.67 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.29 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.66 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.5 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.69 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.23 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1181  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.74 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  51.46 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  51.46 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.95 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.83 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1417  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.47 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.54 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.54 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.54 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.54 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.54 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.73 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.23 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.93 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.54 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>