205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3922 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  95.18 
 
 		 252 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  88.76 
 
 		 249 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  78.71 
 
 		 249 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  73.49 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  73.9 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  73.09 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  77.11 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  77.11 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  77.11 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  77.11 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  77.11 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  77.11 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  73.49 
 
 		 249 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  73.49 
 
 		 249 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  73.49 
 
 		 249 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  77.63 
 
 		 234 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  73.9 
 
 		 249 aa  361  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  54.15 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  56.03 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  53.12 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  54.51 
 
 		 261 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  54.51 
 
 		 261 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  52.03 
 
 		 284 aa  255  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  42.41 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  42.69 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  43.18 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  42.61 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 268 aa  187  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  38.67 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  42.73 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  40.87 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  39.92 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  39.92 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  39.74 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  37.45 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  36.8 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  30.28 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  28.98 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  42.34 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  28.84 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.71 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  27.72 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  29.86 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30.32 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.15 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 276 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  28.21 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  29.03 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  27.18 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.83 
 
 		 322 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.83 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  26.89 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  26.24 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.23 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  27 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  26.11 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  35.92 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.88 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  23.05 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.97 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.97 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.67 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.97 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.26 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  29.32 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  27.66 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.11 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  27.96 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  25.24 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  33.01 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  24.39 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  32.8 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>