More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3914 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  77.78 
 
 
414 aa  683  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  78.38 
 
 
414 aa  681  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 
414 aa  677  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  78.12 
 
 
421 aa  684  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  92.05 
 
 
415 aa  798  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  79.28 
 
 
415 aa  692  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  92.77 
 
 
415 aa  803  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  77.59 
 
 
416 aa  672  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  92.77 
 
 
415 aa  803  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  92.75 
 
 
415 aa  783  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  94.22 
 
 
415 aa  795  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  92.53 
 
 
415 aa  801  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  92.77 
 
 
415 aa  803  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  72.46 
 
 
430 aa  645  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  80.96 
 
 
415 aa  706  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
415 aa  856  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  73.19 
 
 
438 aa  634  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  93.73 
 
 
415 aa  792  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  93.01 
 
 
431 aa  788  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  91.3 
 
 
415 aa  774  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  91.3 
 
 
415 aa  775  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  92.53 
 
 
431 aa  785  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  93.49 
 
 
415 aa  790  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  94.46 
 
 
415 aa  803  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  76.39 
 
 
414 aa  669  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  98.55 
 
 
415 aa  847  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  85.27 
 
 
415 aa  734  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  78.33 
 
 
414 aa  677  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  78.62 
 
 
414 aa  676  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  84.78 
 
 
508 aa  732  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  92.77 
 
 
415 aa  803  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  92.77 
 
 
415 aa  803  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  75.9 
 
 
416 aa  654  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  85.75 
 
 
436 aa  737  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  92.77 
 
 
415 aa  803  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0279  serine hydroxymethyltransferase  78.02 
 
 
414 aa  662  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  79.71 
 
 
415 aa  669  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  94.22 
 
 
415 aa  797  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  84.3 
 
 
415 aa  728  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  93.73 
 
 
415 aa  792  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  78.62 
 
 
414 aa  676  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  78.5 
 
 
414 aa  694  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  84.54 
 
 
415 aa  733  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  77.89 
 
 
414 aa  676  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 
454 aa  605  1e-172  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 
438 aa  606  1e-172  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  69.02 
 
 
416 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 
417 aa  583  1e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  67.63 
 
 
417 aa  583  1e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 
417 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
417 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
417 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 
417 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 
417 aa  578  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
417 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
417 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
417 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  575  1e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  65.46 
 
 
417 aa  575  1e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
417 aa  577  1e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  577  1e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  577  1e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  65.46 
 
 
417 aa  576  1e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  65.22 
 
 
417 aa  571  1e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  64.66 
 
 
416 aa  571  1e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  65.46 
 
 
417 aa  572  1e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 
430 aa  572  1e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 
417 aa  571  1e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 
417 aa  574  1e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 
414 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 
414 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
417 aa  565  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 
417 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  7.7829e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  64.49 
 
 
417 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.44868e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  64.01 
 
 
417 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 
417 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.71586e-07  hitchhiker  1.2571e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 
417 aa  561  1e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  65.07 
 
 
417 aa  564  1e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 
417 aa  563  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 
417 aa  562  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 
417 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 
419 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 
412 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 
418 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  65.28 
 
 
419 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
417 aa  555  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  63.94 
 
 
417 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 
417 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 
417 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1126  serine hydroxymethyltransferase  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2704  serine hydroxymethyltransferase  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2704  serine hydroxymethyltransferase  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 
417 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02443  serine hydroxymethyltransferase  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2916  serine hydroxymethyltransferase  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02407  hypothetical protein  64.73 
 
 
417 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>