173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3899 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  80 
 
 
449 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  79.77 
 
 
886 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  80.73 
 
 
434 aa  717    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  81.42 
 
 
434 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  81.34 
 
 
434 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  80.05 
 
 
435 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  100 
 
 
436 aa  897    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  81.11 
 
 
434 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  80.88 
 
 
434 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  81.34 
 
 
434 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  93.35 
 
 
436 aa  845    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  80 
 
 
435 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  80 
 
 
435 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  79.31 
 
 
449 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  80 
 
 
435 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  81.11 
 
 
434 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  80 
 
 
435 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  87.39 
 
 
436 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  66.9 
 
 
422 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  66.67 
 
 
423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  66.67 
 
 
423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  65.95 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  65.24 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  61.37 
 
 
429 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  58.18 
 
 
429 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  60.28 
 
 
424 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  57.92 
 
 
422 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  57.45 
 
 
422 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  57.72 
 
 
433 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  58.39 
 
 
422 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  53.77 
 
 
427 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  58.39 
 
 
421 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  51.29 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  56.34 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  54.72 
 
 
418 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  54.89 
 
 
420 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  51.03 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  53.48 
 
 
444 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  51.24 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  53.21 
 
 
413 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  49.89 
 
 
438 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  51.19 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  48.97 
 
 
429 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  51.28 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  51.78 
 
 
416 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  50.48 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  51.27 
 
 
430 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  48.98 
 
 
438 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  51.86 
 
 
430 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  50.81 
 
 
430 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  52.05 
 
 
438 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  48.87 
 
 
424 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  47.74 
 
 
440 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  47.91 
 
 
431 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  49.3 
 
 
431 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  51.16 
 
 
432 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  50.34 
 
 
421 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  47.37 
 
 
429 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  50 
 
 
430 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  50.93 
 
 
432 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  48.2 
 
 
424 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  48.64 
 
 
445 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  49.53 
 
 
431 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  48.31 
 
 
441 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  47.62 
 
 
440 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  48.31 
 
 
425 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  46.05 
 
 
437 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  50.56 
 
 
436 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  48.64 
 
 
431 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  49.89 
 
 
436 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  47.86 
 
 
390 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  48.3 
 
 
436 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  47.38 
 
 
426 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  49.32 
 
 
435 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  47.11 
 
 
429 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  47.38 
 
 
405 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  46.14 
 
 
440 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  46.14 
 
 
440 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  46.46 
 
 
413 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  45.82 
 
 
462 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  48.22 
 
 
398 aa  362  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  46.06 
 
 
404 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  49.22 
 
 
394 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  45.83 
 
 
417 aa  359  5e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  48.31 
 
 
394 aa  358  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  44.87 
 
 
434 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  47.19 
 
 
397 aa  348  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  45.48 
 
 
412 aa  342  9e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  46.44 
 
 
423 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  45.92 
 
 
431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  46.19 
 
 
378 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  45.75 
 
 
431 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  44.69 
 
 
398 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  44.19 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  43.81 
 
 
391 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  43.95 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  42.76 
 
 
450 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  42.24 
 
 
401 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  41.59 
 
 
394 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08108  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05160)  38.15 
 
 
435 aa  279  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54519  normal  0.879203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>