More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3827 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  100 
 
 
187 aa  376  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  56.88 
 
 
164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  60.69 
 
 
168 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  57.05 
 
 
167 aa  178  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  52.98 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  58.9 
 
 
163 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  58.9 
 
 
163 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  57.43 
 
 
167 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  54.42 
 
 
155 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  52.44 
 
 
155 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 
155 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 
156 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  53.95 
 
 
155 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  54.11 
 
 
155 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  54.11 
 
 
155 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  54.11 
 
 
155 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  53.06 
 
 
155 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  52.38 
 
 
155 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  52.38 
 
 
155 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  52.38 
 
 
155 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  52.38 
 
 
155 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  52.38 
 
 
155 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  54.37 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  54.37 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  54.37 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  54.37 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  54.37 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  54.37 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  52.38 
 
 
155 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  52.05 
 
 
167 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  54.11 
 
 
158 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  49.66 
 
 
158 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  45.52 
 
 
151 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  45.52 
 
 
151 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  44.14 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  45.83 
 
 
156 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  46.58 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  46.36 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  47.59 
 
 
157 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  48.05 
 
 
166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  48.05 
 
 
166 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  46.21 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  43.06 
 
 
156 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38.96 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  42.07 
 
 
157 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
153 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  46.58 
 
 
166 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
159 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  44.37 
 
 
151 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  40.51 
 
 
157 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  40.69 
 
 
159 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
159 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  40.54 
 
 
151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  38.31 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  38.31 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  38.31 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  38.31 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  38.31 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  38.31 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
157 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  44 
 
 
155 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.24 
 
 
155 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  39.86 
 
 
151 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  39.86 
 
 
151 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  38.78 
 
 
151 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  39.73 
 
 
201 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  39.87 
 
 
157 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  39.86 
 
 
155 aa  98.6  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  39.73 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  42 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  39.73 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.36 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  37.72 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
155 aa  95.9  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  44.76 
 
 
318 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
156 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  38.71 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  38.79 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  40.25 
 
 
154 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
144 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  41.5 
 
 
158 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
156 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  38.78 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
316 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36.31 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
148 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  35.86 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  37.58 
 
 
156 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.56 
 
 
152 aa  87.8  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>