131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3696 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  100 
 
 
226 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  95.58 
 
 
226 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  88.5 
 
 
226 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  81.42 
 
 
236 aa  349  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  78.76 
 
 
226 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  80.53 
 
 
226 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  80.53 
 
 
226 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  80.09 
 
 
226 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
226 aa  333  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  80.09 
 
 
226 aa  332  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  78.32 
 
 
226 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
236 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
236 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
226 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  79.65 
 
 
236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
226 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  79.65 
 
 
236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  53.07 
 
 
230 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  52.21 
 
 
230 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  48.26 
 
 
230 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  55.31 
 
 
229 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  53.1 
 
 
229 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  52.65 
 
 
229 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  51.06 
 
 
238 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  48.42 
 
 
223 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  47.35 
 
 
225 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  44.13 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  45.78 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  45.29 
 
 
233 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  42.53 
 
 
227 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  47.09 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  48.64 
 
 
259 aa  158  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  49.11 
 
 
237 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  45.33 
 
 
228 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  41.98 
 
 
250 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  41.07 
 
 
235 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  41.63 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  38.46 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  41.63 
 
 
231 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  45.66 
 
 
224 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  36.73 
 
 
288 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  45.21 
 
 
224 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  42.15 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  41.55 
 
 
224 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  41.55 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  35.59 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  38.07 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  37.44 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  40.64 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  36.97 
 
 
230 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  43.84 
 
 
223 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  40.18 
 
 
227 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  42.92 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  36.92 
 
 
224 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  40 
 
 
224 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  40 
 
 
224 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  33.65 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  35 
 
 
229 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  34.4 
 
 
224 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  36.14 
 
 
269 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  38.6 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  35.87 
 
 
237 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  33.63 
 
 
240 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  39.37 
 
 
229 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  35.87 
 
 
288 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
240 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  33.18 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  32.91 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  33.49 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  33.05 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  32.57 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  35.16 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  36.53 
 
 
224 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  37.27 
 
 
239 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  33.8 
 
 
225 aa  88.6  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  35.81 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  31.17 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  33.8 
 
 
309 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  33.96 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  33.19 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  25.76 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  35.5 
 
 
223 aa  85.1  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  31.28 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  36.57 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  33.93 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.98 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30.67 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  32.74 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  32.24 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  32.43 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  26.22 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  30.6 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  31.98 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  30.43 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  25.88 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  30.87 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  24.44 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>