More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3577 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
437 aa  860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  83.87 
 
 
437 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  71.07 
 
 
439 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  71.95 
 
 
439 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  72.18 
 
 
439 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  72.18 
 
 
439 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  72.18 
 
 
439 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  72.18 
 
 
439 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  71.95 
 
 
439 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_003296  RS02317  transporter transmembrane protein  49.27 
 
 
409 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.14358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
461 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.92 
 
 
468 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  47.33 
 
 
461 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  47.06 
 
 
442 aa  349  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.42 
 
 
450 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.66 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  45.53 
 
 
441 aa  339  5e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  44.21 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  47.91 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  44.21 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  43.99 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  41.81 
 
 
430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.01 
 
 
437 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  43.42 
 
 
439 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  45.61 
 
 
430 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  43.63 
 
 
435 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.29 
 
 
445 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  43.5 
 
 
461 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  43.5 
 
 
461 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  43.5 
 
 
461 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  43.75 
 
 
435 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.36 
 
 
439 aa  332  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  43.52 
 
 
435 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  39.41 
 
 
465 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  43.52 
 
 
435 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  43.29 
 
 
435 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  40.52 
 
 
465 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  43.37 
 
 
450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  42.07 
 
 
438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  44 
 
 
434 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.32 
 
 
439 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
442 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  42.49 
 
 
438 aa  329  7e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.69 
 
 
439 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  42.49 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.49 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  42.49 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  43.2 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  42.49 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  42.49 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  42.25 
 
 
438 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  43.84 
 
 
439 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  45.05 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.83 
 
 
432 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.83 
 
 
432 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.83 
 
 
432 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.09 
 
 
433 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  43.56 
 
 
436 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  43.32 
 
 
436 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.32 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
437 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
449 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  42.09 
 
 
449 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.2 
 
 
450 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  42.58 
 
 
434 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  41.93 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  45.1 
 
 
455 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 
458 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  44.01 
 
 
447 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.57 
 
 
435 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  41.4 
 
 
434 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  44.06 
 
 
439 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.57 
 
 
435 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.57 
 
 
435 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  43.46 
 
 
438 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  42.65 
 
 
455 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  41.87 
 
 
436 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  41.94 
 
 
436 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  43.69 
 
 
437 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.99 
 
 
441 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
431 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.13 
 
 
439 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.16 
 
 
436 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  42.3 
 
 
460 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 
436 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  40.42 
 
 
435 aa  315  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
465 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  41.52 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  41.87 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  46.77 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.46 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  46.77 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  46.51 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  44.31 
 
 
445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>