297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3354 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
418 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  72.05 
 
 
426 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  68.9 
 
 
428 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  62.59 
 
 
415 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  63.61 
 
 
419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  57.29 
 
 
417 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  54.57 
 
 
424 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  53.15 
 
 
436 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  56.76 
 
 
487 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  55.96 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  55.06 
 
 
406 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  54.16 
 
 
425 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  49.89 
 
 
474 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  58.77 
 
 
323 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  49.78 
 
 
447 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  48.42 
 
 
491 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  50 
 
 
476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  54.55 
 
 
472 aa  355  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  54.04 
 
 
472 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  50 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  54.04 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  54.04 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  49.46 
 
 
476 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  54.04 
 
 
472 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  49.78 
 
 
476 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  49.78 
 
 
476 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  54.29 
 
 
472 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  53.54 
 
 
472 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  50.36 
 
 
471 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.61 
 
 
328 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  44.64 
 
 
305 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  40.34 
 
 
416 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  38.44 
 
 
417 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  40.23 
 
 
417 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  41.79 
 
 
416 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  37.46 
 
 
324 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  36.47 
 
 
329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  37.03 
 
 
338 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  35.69 
 
 
331 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  35.4 
 
 
727 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  35.93 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  34.63 
 
 
327 aa  186  8e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  38.89 
 
 
320 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  33.82 
 
 
318 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  33.53 
 
 
657 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 
336 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  31.99 
 
 
373 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.81 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  34.88 
 
 
320 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
350 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.72 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  33.24 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  31.77 
 
 
495 aa  143  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  43.72 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.44 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  43.41 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  41.21 
 
 
437 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.95 
 
 
313 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 
350 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 
368 aa  123  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.43 
 
 
313 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 
328 aa  120  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.41 
 
 
423 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
308 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  29.66 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  29.79 
 
 
315 aa  113  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.63 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  32.89 
 
 
444 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  34.56 
 
 
460 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  34.56 
 
 
460 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
383 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
490 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 
334 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 
400 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 
456 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  25.95 
 
 
388 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 
456 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.87 
 
 
406 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.33 
 
 
357 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
372 aa  99.8  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 
671 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 
310 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.25 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  32.57 
 
 
483 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  33.88 
 
 
239 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
342 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.73 
 
 
435 aa  93.2  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 
335 aa  93.2  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  24.51 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
412 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 
652 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>