More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3248 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  97.84 
 
 
232 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  89.13 
 
 
232 aa  416  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  88.36 
 
 
232 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  88.36 
 
 
232 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  87.88 
 
 
232 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  87.88 
 
 
232 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  88.36 
 
 
232 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  87.88 
 
 
232 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  87.88 
 
 
232 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  85.71 
 
 
234 aa  400  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  85.71 
 
 
234 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  85.71 
 
 
232 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  85.71 
 
 
234 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  85.71 
 
 
234 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  85.71 
 
 
232 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  85.71 
 
 
234 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  85.71 
 
 
234 aa  400  1e-110  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  67.26 
 
 
226 aa  308  3e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  67.98 
 
 
235 aa  308  6e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 
231 aa  304  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  64.6 
 
 
231 aa  303  2e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.88 
 
 
229 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.68 
 
 
226 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.68 
 
 
225 aa  295  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.77 
 
 
234 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.77 
 
 
234 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.68 
 
 
225 aa  295  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.79 
 
 
230 aa  294  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.68 
 
 
225 aa  294  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.68 
 
 
225 aa  293  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.68 
 
 
225 aa  293  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.45 
 
 
229 aa  293  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  63.23 
 
 
225 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  63.23 
 
 
225 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.78 
 
 
225 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.78 
 
 
225 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  65.07 
 
 
234 aa  291  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.23 
 
 
225 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.33 
 
 
225 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.33 
 
 
225 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.33 
 
 
225 aa  288  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  63.6 
 
 
230 aa  288  5e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  61.88 
 
 
225 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  62.82 
 
 
236 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  63.51 
 
 
234 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  58.26 
 
 
230 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  60.71 
 
 
225 aa  282  4e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  60.76 
 
 
247 aa  281  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.68 
 
 
209 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.68 
 
 
209 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.68 
 
 
209 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.03864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  56.33 
 
 
230 aa  274  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.17 
 
 
248 aa  274  1e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  56.36 
 
 
231 aa  265  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  58.11 
 
 
229 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  57.78 
 
 
231 aa  261  5e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 
231 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  56.58 
 
 
230 aa  258  5e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  57.58 
 
 
232 aa  258  5e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 
231 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  56.44 
 
 
231 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  56 
 
 
231 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  54.35 
 
 
230 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  55.65 
 
 
230 aa  252  4e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 
241 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.54 
 
 
230 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  54.02 
 
 
230 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 
235 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 
235 aa  238  6e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 
233 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
230 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 
231 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 
231 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  48.91 
 
 
231 aa  233  1e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  60 
 
 
250 aa  234  1e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
230 aa  233  1e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  52.49 
 
 
226 aa  232  4e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  53.33 
 
 
228 aa  231  8e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
228 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 
227 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0348  two component transcriptional regulator  63.4 
 
 
215 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
240 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 
235 aa  228  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.94 
 
 
226 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 
233 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 
235 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 
228 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 
231 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  50.44 
 
 
244 aa  224  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 
230 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.21608e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 
230 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 
240 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.42123e-13 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  51.77 
 
 
244 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 
231 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
232 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 
231 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  49.56 
 
 
232 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 
232 aa  221  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
226 aa  221  1e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>