273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3162 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  100 
 
 		 79 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  78.48 
 
 		 79 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  72.31 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  60.32 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  57.14 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  57.63 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  59.65 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  50 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  42.65 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  50 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  50.88 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  53.03 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  49.18 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  49.12 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  49.12 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  56.14 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  32.89 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  42.19 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 835 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.91 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  43.55 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  40.26 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  45.07 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  42.19 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  45.16 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  45.16 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  40.68 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  45.16 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  43.1 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>