75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3110 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  100 
 
 		 350 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  82.57 
 
 		 350 aa  618  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  50.95 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  40.11 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  32.04 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  30.66 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  27.65 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  28.38 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  27.35 
 
 		 342 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  30.71 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  29.06 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  27.36 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.65 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  25.76 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  27.91 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  27.04 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  27.04 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  26.25 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  27.47 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  27.31 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  27.47 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  26.75 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  26.75 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  27 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  27 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  25.94 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27.15 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  25.55 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  25.94 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  33.13 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.37 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.25 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  29.28 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  27.06 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  23.81 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.37 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.07 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.62 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.59 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  38.96 
 
 		 160 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  28.89 
 
 		 147 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.21 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.57 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.03 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.21 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  24.92 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 200 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.77 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  24.19 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.85 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  23.38 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  23.38 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  31.3 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  25.27 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  25 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  21.77 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 383 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  21.37 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  21.37 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  21.37 
 
 		 451 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.04 
 
 		 379 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.81 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>