68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3106 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  70.82 
 
 
295 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  59.02 
 
 
325 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  59.26 
 
 
336 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  56.17 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  53.27 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  47.04 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  49.85 
 
 
336 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  50.65 
 
 
303 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  50.98 
 
 
286 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  50.49 
 
 
303 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  50.33 
 
 
285 aa  245  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  56.84 
 
 
252 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  42.47 
 
 
381 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  44.34 
 
 
285 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  44.44 
 
 
287 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  41.82 
 
 
310 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  41.06 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  33.55 
 
 
252 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  33.55 
 
 
252 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  36.81 
 
 
268 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  41.95 
 
 
284 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  41.1 
 
 
248 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  37.29 
 
 
237 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  31.54 
 
 
419 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  38.89 
 
 
258 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  39.83 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  38.6 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  33.77 
 
 
263 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  36.82 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  34.42 
 
 
254 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.24 
 
 
369 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  38.27 
 
 
248 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  31.27 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  36.56 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  30.56 
 
 
396 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  34.3 
 
 
247 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  35.08 
 
 
258 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  37 
 
 
247 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  35.74 
 
 
251 aa  136  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  36.36 
 
 
262 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  37.23 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  32.01 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  36.93 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  31.46 
 
 
335 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  35.74 
 
 
262 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  34.71 
 
 
247 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  34.66 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  41.1 
 
 
248 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  34.63 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  33.19 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  35.71 
 
 
255 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  29.37 
 
 
242 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  30.74 
 
 
265 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  32.51 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  33.91 
 
 
236 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  34.63 
 
 
248 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  29.29 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  29.73 
 
 
311 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  29.2 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  29.55 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  28.82 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  29.67 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  27.95 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  36.43 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  26.27 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 
229 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  27.96 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>