16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3100 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  55.56 
 
 		 279 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  49.46 
 
 		 283 aa  95.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  47.47 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  42.71 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  49.38 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  44.44 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  40.86 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  40.28 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1923  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 		 557 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0236907  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  36.71 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3969  group I intron endonuclease  30.39 
 
 		 561 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  32.56 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  32.56 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  32.56 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  31.4 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>