More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3031 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  84.58 
 
 
451 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  94.27 
 
 
420 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  100 
 
 
420 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  70.07 
 
 
416 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  70.63 
 
 
416 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  69.83 
 
 
416 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  70.63 
 
 
416 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  70.25 
 
 
416 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  70.15 
 
 
416 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  70.93 
 
 
416 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  54.61 
 
 
415 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  58.69 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  57.93 
 
 
406 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  53.24 
 
 
440 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  55.61 
 
 
479 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  51.38 
 
 
403 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 
422 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  52.37 
 
 
405 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  55.7 
 
 
406 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  53.72 
 
 
419 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  53.09 
 
 
409 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  53.6 
 
 
403 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  53.22 
 
 
406 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 
406 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  52.97 
 
 
406 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  52.72 
 
 
406 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  52.11 
 
 
403 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  59.27 
 
 
360 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  54.04 
 
 
412 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  52.13 
 
 
408 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  51.12 
 
 
432 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  51.12 
 
 
432 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  52.66 
 
 
424 aa  359  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  53.06 
 
 
410 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  48.27 
 
 
421 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  48.51 
 
 
415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  54.86 
 
 
424 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 
412 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
416 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
411 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  46.59 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  50.25 
 
 
411 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  48.49 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  44.53 
 
 
413 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  46.96 
 
 
408 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  46.96 
 
 
408 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  47.03 
 
 
418 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  46.96 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
397 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  47.12 
 
 
413 aa  305  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  44.61 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  43.76 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  46.78 
 
 
421 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  48.24 
 
 
404 aa  295  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  45.59 
 
 
429 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  42.75 
 
 
454 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  40.67 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  44.36 
 
 
412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  40.62 
 
 
427 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 
401 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  40.35 
 
 
411 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  43.24 
 
 
457 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  43.47 
 
 
403 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  41.63 
 
 
427 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  42.16 
 
 
407 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  42.27 
 
 
414 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
415 aa  264  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  40.51 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  41.65 
 
 
399 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
425 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  38.65 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  39.91 
 
 
437 aa  252  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  40.83 
 
 
499 aa  252  9.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  43.8 
 
 
455 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  37.1 
 
 
424 aa  246  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  39.45 
 
 
414 aa  245  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  40.72 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  39.65 
 
 
418 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 
427 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  33.64 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  39.5 
 
 
410 aa  225  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
414 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.58 
 
 
524 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  34.84 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.59 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
447 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  33.42 
 
 
418 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
422 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.08 
 
 
418 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.85 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
449 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.9 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
442 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.1 
 
 
430 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>