85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3019 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  78.57 
 
 
84 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  76.19 
 
 
94 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  64.71 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  63.53 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  63.53 
 
 
85 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  55.29 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  44.59 
 
 
379 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  44.74 
 
 
386 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  41.24 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  38.27 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  40.22 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  51.92 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
466 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  39.77 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.84 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  36.05 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  46.43 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  46.43 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  46.43 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  56.25 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  38.37 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  37.23 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  49.02 
 
 
1422 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  36.84 
 
 
96 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  40.68 
 
 
592 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  43.18 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  35 
 
 
469 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  45.83 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  46.94 
 
 
1475 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  46.94 
 
 
1457 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  39.39 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  40.3 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  55.26 
 
 
1437 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  31.25 
 
 
481 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  35 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  35.87 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  41.46 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  39.77 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  43.64 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  43.75 
 
 
461 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  44 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  43.64 
 
 
176 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  40.91 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  46.67 
 
 
1379 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  46 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  44.23 
 
 
1229 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  46.81 
 
 
855 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2789  PAAR  55.77 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0285082  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  40.68 
 
 
1446 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  32.5 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  32.97 
 
 
99 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  38.33 
 
 
540 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  36.78 
 
 
100 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  52.63 
 
 
1423 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  35 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
406 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  44.19 
 
 
1140 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  39.22 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0641  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  44.74 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  35 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  39.22 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  39.22 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  32.29 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  39.22 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  39.22 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  38.6 
 
 
1386 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  41.38 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  38.78 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  39.22 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  42.86 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  38.78 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  45.83 
 
 
1530 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  42.86 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  36.25 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  37.74 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  42.86 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  32.99 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  42.31 
 
 
453 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>