More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2960 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1510  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  93.83 
 
 
227 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  80.18 
 
 
228 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  80.18 
 
 
227 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  80.18 
 
 
228 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  79.02 
 
 
227 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  79.73 
 
 
228 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  79.91 
 
 
226 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  79.3 
 
 
229 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  78.41 
 
 
229 aa  361  5e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  77.23 
 
 
226 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  76.13 
 
 
230 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  76.13 
 
 
230 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  76.13 
 
 
230 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  75.68 
 
 
230 aa  352  3e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  68.33 
 
 
226 aa  303  2e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  68.02 
 
 
228 aa  301  4e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  67.57 
 
 
228 aa  301  6e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  2.22676e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  67.42 
 
 
226 aa  301  7e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 
228 aa  294  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  67.57 
 
 
225 aa  294  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  67.57 
 
 
227 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 
228 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 
228 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.95 
 
 
224 aa  290  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  65.47 
 
 
228 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.86 
 
 
224 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  67.41 
 
 
226 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.89 
 
 
226 aa  287  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.39 
 
 
227 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.96 
 
 
230 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  66.07 
 
 
228 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1675  two component heavy metal response transcriptional regulator  66.67 
 
 
226 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294903  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  63.68 
 
 
223 aa  285  6e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.64 
 
 
225 aa  284  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.73 
 
 
226 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.73 
 
 
226 aa  283  2e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  66.22 
 
 
226 aa  282  3e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  63.35 
 
 
229 aa  281  4e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  63.18 
 
 
224 aa  281  5e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  66.67 
 
 
228 aa  281  5e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.73 
 
 
226 aa  281  5e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  63.18 
 
 
225 aa  281  6e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5672  DNA-binding response regulator  66.67 
 
 
228 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.93 
 
 
219 aa  279  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1742  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  67.12 
 
 
228 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.16 
 
 
225 aa  277  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  65.32 
 
 
228 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  61.71 
 
 
226 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.51 
 
 
225 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.51 
 
 
225 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.51 
 
 
225 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3374  heavy metal response regulator  60.81 
 
 
229 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  63.23 
 
 
228 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 
225 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 
225 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 
225 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 
225 aa  274  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.26 
 
 
225 aa  274  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.61 
 
 
225 aa  273  1e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3603  DNA-binding heavy metal response regulator  60.81 
 
 
229 aa  274  1e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.78 
 
 
223 aa  273  2e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64570  two-component response regulator  61.5 
 
 
229 aa  273  2e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00315  probable two component response regulator transcription regulator protein  60.55 
 
 
227 aa  273  2e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.78 
 
 
223 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  61.71 
 
 
225 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.16 
 
 
225 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5607  two-component response regulator  61.95 
 
 
229 aa  271  5e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  60.36 
 
 
226 aa  271  5e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  66.22 
 
 
242 aa  271  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  59.47 
 
 
228 aa  271  9e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.91 
 
 
227 aa  269  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.91 
 
 
227 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.91 
 
 
227 aa  269  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.91 
 
 
227 aa  269  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 
227 aa  269  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.91 
 
 
227 aa  269  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  59.91 
 
 
227 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  59.91 
 
 
227 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.33 
 
 
223 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.33 
 
 
223 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 
226 aa  269  3e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.52174e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  62.33 
 
 
223 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  60.36 
 
 
223 aa  268  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.55 
 
 
226 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  59.46 
 
 
226 aa  268  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  64.86 
 
 
227 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  59.01 
 
 
238 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  59.55 
 
 
225 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  61.71 
 
 
232 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  59.55 
 
 
225 aa  265  6e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.69255e-05  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  61.43 
 
 
223 aa  265  6e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  60.36 
 
 
223 aa  264  9e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  63.51 
 
 
227 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>