176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2936 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  100 
 
 
288 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  95.49 
 
 
312 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  84.97 
 
 
287 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  75 
 
 
286 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  74.65 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  74.65 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  73.59 
 
 
309 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  73.94 
 
 
296 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  74.3 
 
 
354 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  74.11 
 
 
287 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  74.11 
 
 
287 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  73.59 
 
 
309 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  73.76 
 
 
287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  73.59 
 
 
286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  73.59 
 
 
286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  73.24 
 
 
309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  73.24 
 
 
286 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  58.16 
 
 
286 aa  322  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  59.22 
 
 
286 aa  321  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  57.09 
 
 
288 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  56.38 
 
 
286 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  56.38 
 
 
286 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  57.09 
 
 
286 aa  318  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  56.69 
 
 
287 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  56.38 
 
 
286 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  56.69 
 
 
287 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  56.38 
 
 
286 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  56.03 
 
 
288 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  315  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  55.67 
 
 
288 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  56.74 
 
 
286 aa  315  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  315  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  315  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  315  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  56.38 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  56.58 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  56.74 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  56.58 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  55.32 
 
 
290 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  55.32 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  56.03 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  54.96 
 
 
290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  56.03 
 
 
288 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  52.54 
 
 
287 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  52.9 
 
 
287 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  51.24 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  50.71 
 
 
289 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  48.75 
 
 
286 aa  280  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  51.25 
 
 
289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  42.86 
 
 
282 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  45.16 
 
 
283 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  44.64 
 
 
283 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  45.52 
 
 
293 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  41.81 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  47.12 
 
 
282 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  43.17 
 
 
282 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  42.96 
 
 
283 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  42.2 
 
 
282 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  42.5 
 
 
283 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  39.65 
 
 
293 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  41.7 
 
 
313 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  41.01 
 
 
283 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  43.64 
 
 
290 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  40.65 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  41.73 
 
 
282 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  41.01 
 
 
283 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  40.77 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  31.63 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  34.86 
 
 
291 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  32.59 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  32.72 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  34.07 
 
 
287 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  37.23 
 
 
289 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  32.83 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  36.62 
 
 
298 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  36.62 
 
 
298 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  36.07 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  32.37 
 
 
300 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  30 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  34.91 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  32.72 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  32.22 
 
 
288 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  32.28 
 
 
288 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  31.62 
 
 
291 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  41.45 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  37.43 
 
 
402 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  34.7 
 
 
298 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  31.07 
 
 
291 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  30.14 
 
 
291 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  34.52 
 
 
334 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  41.45 
 
 
280 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  33.95 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  29.17 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  33.08 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  29.37 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  29.37 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  28.09 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>