74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2800 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  100 
 
 
165 aa  328  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  79.39 
 
 
165 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  56.64 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  49.35 
 
 
155 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  52.35 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  52.35 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  52.35 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  52.35 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  52.35 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  52.35 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  47.33 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.67 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.67 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.67 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  36.88 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  36.88 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  42.48 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  39.41 
 
 
168 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  34.87 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  30.07 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.73 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  31.54 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  34.87 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  34.87 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  29.53 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  30.72 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  35.05 
 
 
189 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  37.84 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  27.63 
 
 
146 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  29.68 
 
 
153 aa  52  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  40 
 
 
181 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  33.75 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  45.9 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  29.25 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  39.62 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  39.62 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  31.3 
 
 
129 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  40.68 
 
 
170 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  32.61 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  32.48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  31.88 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  37.93 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  45.83 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  28.07 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  44.64 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  28.07 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  45.83 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  26.12 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  42.22 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  36.9 
 
 
163 aa  43.9  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  30.09 
 
 
142 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  30.09 
 
 
142 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  34.43 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  32.06 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  41.82 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  41.51 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2343  hypothetical protein  34.45 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  41.51 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  51.92 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  29.07 
 
 
174 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  43.75 
 
 
148 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  44.44 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  27.03 
 
 
179 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  45.83 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  42.55 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  33.33 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  30 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  40 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  29.75 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  37.93 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>