153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2745 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  100 
 
 
135 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  34.43 
 
 
133 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  32 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.85 
 
 
132 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  31.75 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.94 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  32.28 
 
 
137 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.62 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  32.28 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  36.13 
 
 
152 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  36.13 
 
 
152 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.78 
 
 
129 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  33.08 
 
 
132 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.39 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  33.61 
 
 
130 aa  82.8  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  82.4  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.5 
 
 
137 aa  82.4  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.59 
 
 
144 aa  82.8  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.87 
 
 
319 aa  80.9  5e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  80.5  7e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.92 
 
 
130 aa  80.1  9e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  34.45 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.5 
 
 
137 aa  80.1  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  79.3  2e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  79  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  33.07 
 
 
137 aa  78.2  4e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.59 
 
 
315 aa  78.2  4e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  32.12 
 
 
145 aa  77.4  6e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.8 
 
 
321 aa  76.6  1e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.59 
 
 
132 aa  74.3  5e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.06 
 
 
133 aa  73.6  8e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.82 
 
 
139 aa  73.6  8e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  73.6  9e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  73.2  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  27.59 
 
 
311 aa  72.8  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  71.2  4e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.03 
 
 
141 aa  71.6  4e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  28.26 
 
 
136 aa  70.9  6e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  26.77 
 
 
137 aa  70.5  7e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  25.38 
 
 
138 aa  70.1  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  31.2 
 
 
140 aa  70.1  1e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  34.23 
 
 
305 aa  69.3  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  35.48 
 
 
148 aa  68.9  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  35.71 
 
 
145 aa  68.2  3e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  25.2 
 
 
146 aa  67.8  4e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  31.01 
 
 
137 aa  65.1  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  34.35 
 
 
322 aa  65.1  3e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  29.46 
 
 
141 aa  65.1  3e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  63.9  6e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  27.54 
 
 
139 aa  64.3  6e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  32.77 
 
 
129 aa  64.3  6e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  29.41 
 
 
131 aa  63.5  8e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  26.36 
 
 
144 aa  63.5  9e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  29.46 
 
 
550 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  29.46 
 
 
550 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29.13 
 
 
550 aa  62.4  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  26.77 
 
 
136 aa  62.8  2e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  28 
 
 
142 aa  62  2e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  30.71 
 
 
324 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  29.52 
 
 
143 aa  60.8  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  26.23 
 
 
132 aa  61.2  5e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  33 
 
 
144 aa  60.5  7e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.57 
 
 
548 aa  60.5  9e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.83 
 
 
120 aa  60.5  9e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  30.71 
 
 
318 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  30.71 
 
 
318 aa  60.1  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  30.71 
 
 
317 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  30.71 
 
 
317 aa  58.5  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  28.23 
 
 
128 aa  58.2  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  33.62 
 
 
142 aa  58.2  4e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  28.1 
 
 
151 aa  57.4  7e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  26.36 
 
 
140 aa  56.6  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.25 
 
 
136 aa  56.6  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  27.82 
 
 
548 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  31.93 
 
 
130 aa  55.8  2e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  28.57 
 
 
150 aa  55.5  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  25.89 
 
 
140 aa  55.5  2e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  30 
 
 
311 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  30.43 
 
 
156 aa  55.5  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  29.23 
 
 
312 aa  55.5  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  29.66 
 
 
130 aa  54.7  4e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  28.81 
 
 
130 aa  54.7  4e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  35.42 
 
 
131 aa  54.7  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  25.71 
 
 
138 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  28.1 
 
 
124 aa  55.1  4e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  30.43 
 
 
121 aa  54.3  6e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  26.77 
 
 
319 aa  53.9  6e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  26.89 
 
 
141 aa  53.9  7e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.46433e-07  hitchhiker  6.44081e-06 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  25.71 
 
 
138 aa  53.9  8e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  25.71 
 
 
138 aa  53.9  8e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  27.87 
 
 
145 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  32.38 
 
 
130 aa  52.8  1e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  27.87 
 
 
145 aa  53.1  1e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>