More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2744 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  100 
 
 
406 aa  840    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  48.02 
 
 
405 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7490  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  46.77 
 
 
403 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.3 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.29 
 
 
390 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.16 
 
 
385 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  35.56 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.85 
 
 
384 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.19 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.42 
 
 
389 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.83 
 
 
383 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.33 
 
 
383 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.58 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.75 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.75 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.11 
 
 
381 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  33.25 
 
 
379 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.75 
 
 
379 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.59 
 
 
379 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.51 
 
 
379 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  33.58 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.59 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  32.41 
 
 
381 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  31.62 
 
 
390 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.93 
 
 
383 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.51 
 
 
385 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  32.97 
 
 
379 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.28 
 
 
382 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  30.53 
 
 
378 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  30.6 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.67 
 
 
383 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  32.01 
 
 
384 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33.01 
 
 
383 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.94 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.6 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.22 
 
 
389 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.53 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  31.04 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  31.04 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  31.04 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  30.13 
 
 
382 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 
388 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  29.93 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.11 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.72 
 
 
386 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  31.73 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  30.63 
 
 
404 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  30.65 
 
 
394 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.01 
 
 
389 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.89 
 
 
390 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  30.89 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  29.47 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.2 
 
 
387 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  32.16 
 
 
384 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.28 
 
 
382 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.18 
 
 
394 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.11 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 
382 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 
388 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.17 
 
 
388 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  30.32 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.43 
 
 
387 aa  137  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  30.89 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  29.68 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  29.26 
 
 
382 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  30.95 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.17 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  28.64 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.44 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.46 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  29.07 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.61 
 
 
392 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  30.35 
 
 
383 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.61 
 
 
392 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  30.35 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  29.57 
 
 
381 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  31.06 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  29.93 
 
 
395 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  29.1 
 
 
387 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  28.82 
 
 
392 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  28.15 
 
 
400 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  33.85 
 
 
372 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  28.47 
 
 
402 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  28.47 
 
 
402 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  28.47 
 
 
402 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  27.45 
 
 
391 aa  122  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  30.83 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  29.59 
 
 
388 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  27.06 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  29.6 
 
 
390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  29.12 
 
 
403 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  26.73 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  30.65 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.4 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.44 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  28.15 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  31.08 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  30.45 
 
 
390 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>