More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2718 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  100 
 
 
445 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  38.37 
 
 
461 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  38.26 
 
 
453 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  39.29 
 
 
454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  37.79 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  37.79 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  38.03 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  38.12 
 
 
453 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  37.25 
 
 
461 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  37.79 
 
 
453 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  38.26 
 
 
450 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 
451 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  38.03 
 
 
451 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  38.03 
 
 
451 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.03 
 
 
451 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  38.03 
 
 
451 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  38.03 
 
 
451 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  38.03 
 
 
451 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  37.2 
 
 
467 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  37.2 
 
 
467 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  38.03 
 
 
451 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.99 
 
 
475 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  36.96 
 
 
467 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  37.74 
 
 
579 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.03 
 
 
452 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  38.2 
 
 
454 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  34.21 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  37.44 
 
 
468 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.23 
 
 
447 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
454 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  39.7 
 
 
441 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.7 
 
 
455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  36.57 
 
 
460 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.56 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  36.11 
 
 
460 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  37.2 
 
 
453 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  36.11 
 
 
460 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  37.39 
 
 
453 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  38.43 
 
 
451 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  37.83 
 
 
453 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  37.83 
 
 
453 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.2 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  34.82 
 
 
452 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  38.05 
 
 
453 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.81 
 
 
441 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  35.23 
 
 
442 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  35 
 
 
442 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  35.17 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  34.73 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  34.92 
 
 
445 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  35.23 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  33.11 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.56 
 
 
449 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
452 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  34.62 
 
 
452 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  34.02 
 
 
451 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
439 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
451 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
439 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  35.11 
 
 
452 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  35.09 
 
 
452 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.71 
 
 
452 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  33.78 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  36.32 
 
 
452 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  36.32 
 
 
452 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  33.02 
 
 
448 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  33.33 
 
 
454 aa  226  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  36.32 
 
 
452 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  36.32 
 
 
452 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  35.94 
 
 
455 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35.77 
 
 
449 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
448 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  34.3 
 
 
453 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
458 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.37 
 
 
446 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.02 
 
 
448 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.26 
 
 
454 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2519  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.85 
 
 
452 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 
463 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  33.41 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
458 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.56 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  33.74 
 
 
448 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.99 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.88 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  35.42 
 
 
449 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.47 
 
 
465 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  32.71 
 
 
448 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  35.32 
 
 
454 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  35.8 
 
 
446 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  34.88 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  35.1 
 
 
461 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  33.49 
 
 
456 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  34.39 
 
 
466 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  34.39 
 
 
466 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  32.86 
 
 
447 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  34.87 
 
 
452 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.67 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.11 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>