More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2698 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  100 
 
 
391 aa  752    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.8 
 
 
405 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  42.54 
 
 
405 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  43.7 
 
 
405 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  43.7 
 
 
405 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  43.7 
 
 
405 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  41.02 
 
 
405 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  45.28 
 
 
401 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  39.89 
 
 
404 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  41.8 
 
 
400 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  41.8 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  41.53 
 
 
400 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  41.99 
 
 
398 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.63 
 
 
393 aa  222  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.06 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  40.35 
 
 
389 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  40.35 
 
 
389 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  42.02 
 
 
398 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.47 
 
 
404 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
388 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.41 
 
 
398 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  40.73 
 
 
396 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  34.64 
 
 
406 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  34.64 
 
 
406 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  35.47 
 
 
403 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  41.28 
 
 
407 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
447 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  40.05 
 
 
405 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
402 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  40.5 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  34.3 
 
 
392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  42.36 
 
 
399 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.15 
 
 
394 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.07 
 
 
399 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.07 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.07 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  42.5 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  42.09 
 
 
399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  40.06 
 
 
406 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  42.63 
 
 
401 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.06 
 
 
403 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  42.94 
 
 
408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  41.74 
 
 
402 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  40.25 
 
 
413 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.21 
 
 
399 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  39.66 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  35.93 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.16 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.19 
 
 
399 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.5 
 
 
399 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.03 
 
 
411 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.54 
 
 
383 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  37.66 
 
 
416 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.68 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.68 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.68 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.68 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.68 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  36.68 
 
 
394 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
406 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  35.63 
 
 
415 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
399 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  34.54 
 
 
407 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.07 
 
 
394 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.39 
 
 
394 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  37.78 
 
 
394 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  37.78 
 
 
394 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  37.78 
 
 
394 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  37.78 
 
 
394 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
403 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
399 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  35.68 
 
 
433 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
389 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
413 aa  156  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
415 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
406 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  39.71 
 
 
403 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  39.4 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.57 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  36.07 
 
 
399 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  34.17 
 
 
395 aa  152  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  36.84 
 
 
421 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.38 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  36.55 
 
 
422 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  37.57 
 
 
431 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  35.94 
 
 
427 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  34.17 
 
 
426 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
413 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
419 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  37.96 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  35.49 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  32.41 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  39.52 
 
 
412 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  38.92 
 
 
412 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  39.52 
 
 
412 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  33.06 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  42.61 
 
 
409 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>