More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2696 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  46.26 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  45.81 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  45.81 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  45.81 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  45.81 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  45.81 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.23 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  42.79 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 		 235 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 		 235 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  42.36 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  42.36 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 		 332 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  43.69 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.36 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  43.05 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  43.87 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  43.05 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  43.24 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 237 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.5 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  31.9 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.08 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  33.19 
 
 		 417 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20980  putative short chain dehydrogenas  33.17 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  33.05 
 
 		 544 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 344 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 291 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.03 
 
 		 417 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 278 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>