21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2656 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  100 
 
 		 106 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  91.43 
 
 		 106 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  89.62 
 
 		 114 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  80.95 
 
 		 110 aa  174  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  78.85 
 
 		 110 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  74.29 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  74.04 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  71.43 
 
 		 106 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  39.22 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  41.35 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  39.22 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  30.77 
 
 		 924 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  32.61 
 
 		 915 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  29.03 
 
 		 922 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0871  type IV secretory pathway VirB3 family protein  36.73 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  33.7 
 
 		 916 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2442  type IV secretory pathway VirB3 family protein  37.5 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.79385 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4377  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  35.64 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  29.46 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.59 
 
 		 915 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  28.71 
 
 		 112 aa  40.8  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>