More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2636 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
203 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  45.76 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
289 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  38.16 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.46 
 
 
400 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
234 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  32.57 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
197 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
206 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  34.12 
 
 
212 aa  51.6  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 
205 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  39.02 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.26 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  41.67 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  32.93 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  28.25 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  43.86 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  40.35 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
87 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  31.85 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>