115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2529 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  53.25 
 
 		 839 aa  813    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 		 853 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  53.37 
 
 		 839 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  53.69 
 
 		 816 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  54.67 
 
 		 839 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  100 
 
 		 882 aa  1789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  51.12 
 
 		 856 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  52.16 
 
 		 828 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  52.6 
 
 		 827 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  52.16 
 
 		 828 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  53.25 
 
 		 839 aa  813    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  53.25 
 
 		 839 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  53.44 
 
 		 839 aa  816    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  53.25 
 
 		 839 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  53.25 
 
 		 839 aa  813    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  46.49 
 
 		 816 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  53.59 
 
 		 825 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  47.64 
 
 		 811 aa  648    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  52.16 
 
 		 828 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  53.99 
 
 		 812 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  85.81 
 
 		 882 aa  1542    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  47.34 
 
 		 826 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  48.47 
 
 		 820 aa  728    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  48.55 
 
 		 826 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  40.03 
 
 		 821 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  35.89 
 
 		 815 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  30.48 
 
 		 829 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.01 
 
 		 835 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5357  hypothetical protein  39.31 
 
 		 648 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 863 aa  188  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.63 
 
 		 819 aa  189  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  23.91 
 
 		 813 aa  184  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  26.87 
 
 		 823 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  28.68 
 
 		 861 aa  182  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 871 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  23.99 
 
 		 837 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.85 
 
 		 845 aa  174  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  26.28 
 
 		 838 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.32 
 
 		 813 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  26.11 
 
 		 860 aa  172  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  25.08 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  25.55 
 
 		 864 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  28.2 
 
 		 839 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.31 
 
 		 845 aa  164  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.12 
 
 		 872 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  26.95 
 
 		 837 aa  162  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  26.55 
 
 		 891 aa  160  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 891 aa  158  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  28.31 
 
 		 880 aa  157  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.38 
 
 		 842 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.03 
 
 		 817 aa  155  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  29.19 
 
 		 812 aa  155  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  27.86 
 
 		 833 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.4 
 
 		 818 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  25.48 
 
 		 875 aa  154  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  29.46 
 
 		 831 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 897 aa  152  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  24.77 
 
 		 815 aa  151  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  28.3 
 
 		 824 aa  148  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 		 785 aa  145  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 786 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  28.74 
 
 		 846 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  27.23 
 
 		 802 aa  141  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  26.82 
 
 		 840 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  24.84 
 
 		 819 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 663 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  24.88 
 
 		 819 aa  138  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  28.6 
 
 		 824 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  24.64 
 
 		 802 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  27.21 
 
 		 799 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.56 
 
 		 843 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 793 aa  129  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.66 
 
 		 845 aa  128  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  24.66 
 
 		 843 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 763 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  28.31 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.2 
 
 		 940 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21.47 
 
 		 906 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.58 
 
 		 984 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.01 
 
 		 971 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 724 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 739 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.42 
 
 		 878 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.06 
 
 		 744 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 		 1064 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.39 
 
 		 720 aa  62.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.03 
 
 		 800 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 1144 aa  57.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.67 
 
 		 1362 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  36.72 
 
 		 602 aa  57  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.64 
 
 		 609 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.32 
 
 		 799 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.86 
 
 		 609 aa  51.6  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.13 
 
 		 1033 aa  51.6  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25.99 
 
 		 603 aa  50.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.99 
 
 		 929 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.14 
 
 		 624 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  26.09 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.37 
 
 		 640 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>