56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2518 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  100 
 
 
486 aa  956    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  56.47 
 
 
488 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  56.47 
 
 
488 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  53.48 
 
 
488 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  56.47 
 
 
488 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  54.84 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  54 
 
 
488 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  55.69 
 
 
492 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  57.08 
 
 
488 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  53.39 
 
 
488 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  53.39 
 
 
488 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  56.76 
 
 
498 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  53.62 
 
 
484 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  53.62 
 
 
484 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  56.88 
 
 
488 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  53.62 
 
 
484 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  53.62 
 
 
484 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  53.62 
 
 
484 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  56.67 
 
 
488 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  35.59 
 
 
488 aa  236  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  34.08 
 
 
499 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  34.08 
 
 
499 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 
478 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
473 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
429 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 
509 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  28.54 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
422 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 
419 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
504 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.06 
 
 
504 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
499 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 
504 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
484 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
443 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.19 
 
 
484 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  26.32 
 
 
506 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 
507 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
446 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  29.92 
 
 
467 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.98 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  31.94 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  31.94 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  31.94 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  31.94 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  24.52 
 
 
501 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  31.51 
 
 
496 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
483 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  25.9 
 
 
486 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 
448 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>