203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2497 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  100 
 
 
332 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.31 
 
 
332 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.36 
 
 
326 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  63.06 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.74 
 
 
328 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.89 
 
 
344 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
321 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
312 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
316 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
315 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
300 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
309 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
319 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
318 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
307 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
304 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
317 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
319 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  30.79 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  30.79 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  30.79 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.51 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.51 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  30.79 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  29.81 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.85 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  26.95 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.42 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  24.34 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.53 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  20.66 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.91 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.96 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.01 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
270 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.45 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>