More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2482 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  100 
 
 
530 aa  1088    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  84.72 
 
 
530 aa  918    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 
1406 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  40.64 
 
 
648 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.76 
 
 
1764 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  34.31 
 
 
725 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  36.03 
 
 
652 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  36.58 
 
 
697 aa  263  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  34.64 
 
 
695 aa  256  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  36.63 
 
 
700 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  35.84 
 
 
663 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  35.28 
 
 
669 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  34.64 
 
 
634 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  34.44 
 
 
677 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 
573 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  36.55 
 
 
542 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  32.92 
 
 
673 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  32.98 
 
 
542 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  33.26 
 
 
536 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  33.72 
 
 
604 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  35.28 
 
 
717 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  33.87 
 
 
656 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.54 
 
 
637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  32.84 
 
 
720 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  32.66 
 
 
525 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  32.32 
 
 
578 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  28.83 
 
 
532 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  35.33 
 
 
322 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.88 
 
 
527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 
899 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  28.41 
 
 
889 aa  166  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.64 
 
 
762 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  29.64 
 
 
762 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  30.71 
 
 
533 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
685 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  34.61 
 
 
670 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  28.13 
 
 
742 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  29.49 
 
 
524 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
713 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
548 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.05 
 
 
514 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.76 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  32.58 
 
 
549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  25.1 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  28.66 
 
 
531 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  29.77 
 
 
624 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  27.38 
 
 
614 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.45 
 
 
546 aa  133  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  26.61 
 
 
482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  26.65 
 
 
625 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  28 
 
 
488 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
510 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.07 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  30.07 
 
 
307 aa  113  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  24.5 
 
 
636 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  33.06 
 
 
519 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 
810 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
878 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
615 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.39 
 
 
887 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
1737 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  28.18 
 
 
626 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 
639 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
614 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  39.71 
 
 
626 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
614 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  39.71 
 
 
626 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
614 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  39.71 
 
 
614 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  39.71 
 
 
614 aa  87.8  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.32 
 
 
795 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  23.67 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
1486 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.61 
 
 
620 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 
612 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 
636 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
3301 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.83 
 
 
626 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
3172 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
598 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
635 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
635 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
611 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
637 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
927 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.88 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.47 
 
 
714 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
681 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
4489 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.24 
 
 
745 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
762 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.91 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  36.64 
 
 
864 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
547 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>