55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2398 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2398  Phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 103 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592161  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  36.67 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  36.21 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  32.84 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  31.34 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  35 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  35.82 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 72 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  37.66 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  26.44 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  36.36 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  30 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0948  phage transcriptional regulator, AlpA  31.75 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  34.29 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3863  AlpA family protein  31.75 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0520497  hitchhiker  0.0087856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0893  AlpA family protein  31.75 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  40 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 127 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 72 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  30.51 
 
 		 78 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  29.63 
 
 		 86 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2334  hypothetical protein  35.85 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.31954  hitchhiker  0.0000000198775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2092  hypothetical protein  35.85 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  26.67 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0279  prophage CP4-57 regulatory protein  30.77 
 
 		 72 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00300713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  29.03 
 
 		 88 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  29.73 
 
 		 81 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  37.04 
 
 		 81 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  29.69 
 
 		 73 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  33.78 
 
 		 127 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 67 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>