More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2370 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  88.89 
 
 
152 aa  262  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  87.6 
 
 
132 aa  223  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  85.37 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  85.37 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  85.37 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  85.37 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  84.55 
 
 
132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  84.55 
 
 
132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  84.55 
 
 
132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  86.29 
 
 
132 aa  209  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  81.68 
 
 
144 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  80.92 
 
 
144 aa  204  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  76.98 
 
 
144 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  78.95 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  81.4 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  81.4 
 
 
144 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  78.74 
 
 
145 aa  193  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  68.07 
 
 
133 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.14 
 
 
152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  68.64 
 
 
129 aa  168  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.75 
 
 
138 aa  166  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.34 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  59.52 
 
 
128 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  58.73 
 
 
128 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  60.17 
 
 
128 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  60.17 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.17 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  60.17 
 
 
128 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.79 
 
 
299 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  58.82 
 
 
134 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  67.62 
 
 
123 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 
125 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  74.23 
 
 
110 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  72.16 
 
 
109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.17 
 
 
125 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  68.04 
 
 
118 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.97 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  50.81 
 
 
275 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  53.23 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.09 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.45 
 
 
260 aa  124  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  47.5 
 
 
150 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  47.06 
 
 
295 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  57.14 
 
 
261 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  50.89 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.67 
 
 
136 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.54 
 
 
127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  41.6 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
129 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.8 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  38.21 
 
 
392 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.66 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.71 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  42.42 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  38.18 
 
 
298 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  51.09 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.57 
 
 
396 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  42.71 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.71 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  38.05 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  39.64 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.17 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  42.22 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.78 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  37.38 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  38.74 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.11 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.25 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.38 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.89 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.8 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.89 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.39 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  37.89 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.82 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.52 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.13 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.59 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  42.39 
 
 
397 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  34.35 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  43.21 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
402 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  40.91 
 
 
390 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>