More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2331 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  94.27 
 
 
279 aa  530  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  83.87 
 
 
279 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
454 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
568 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
281 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
281 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
281 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
281 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  82.01 
 
 
281 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  81.65 
 
 
281 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  80.58 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  80.58 
 
 
281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  80.58 
 
 
281 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  80.58 
 
 
316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  81.29 
 
 
281 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  79.5 
 
 
281 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  80.58 
 
 
316 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  71.79 
 
 
307 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  69.96 
 
 
284 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  62.24 
 
 
285 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  62.24 
 
 
310 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  72.65 
 
 
285 aa  341  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  54.12 
 
 
276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  66.51 
 
 
235 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  59.91 
 
 
281 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  62.05 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  62.33 
 
 
236 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  58.75 
 
 
296 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  61.11 
 
 
241 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  59.83 
 
 
296 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  50.18 
 
 
302 aa  260  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  61.11 
 
 
236 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  64.39 
 
 
237 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  58.8 
 
 
237 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  56.17 
 
 
237 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  57.92 
 
 
237 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  55.35 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  56.8 
 
 
275 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  51.57 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  58.8 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  58.8 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  47.86 
 
 
410 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  50.45 
 
 
410 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  49.55 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  46.32 
 
 
369 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 
418 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  43.87 
 
 
405 aa  198  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 
438 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 
406 aa  195  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 
404 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  49.55 
 
 
412 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  52.26 
 
 
327 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
405 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.96 
 
 
418 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.05 
 
 
429 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  46.96 
 
 
325 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  47.03 
 
 
326 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  47.88 
 
 
406 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 
404 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  49.55 
 
 
405 aa  191  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  48.29 
 
 
432 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 
398 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 
415 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  46.72 
 
 
280 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 
404 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  44.69 
 
 
404 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  49.12 
 
 
419 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 
408 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  49.55 
 
 
405 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.32 
 
 
404 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 
298 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
298 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 
298 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  46.82 
 
 
328 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  46.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
322 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  49.26 
 
 
289 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  47.86 
 
 
407 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.11 
 
 
404 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 
429 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.56 
 
 
404 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 
322 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  47.95 
 
 
325 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  45.71 
 
 
411 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.13 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  46.94 
 
 
404 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>