More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2246 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  69.16 
 
 
460 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  69.53 
 
 
457 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3723  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  70.6 
 
 
457 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0732572  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  69.66 
 
 
460 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2246  undecaprenyl- phosphate galactosephosphotransferase  100 
 
 
465 aa  943    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.357334  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  83.66 
 
 
465 aa  809    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  69.16 
 
 
460 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  71.24 
 
 
478 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5546  sugar transferase  70.6 
 
 
477 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383958  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  71.24 
 
 
478 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  70.32 
 
 
477 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3704  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  71.24 
 
 
457 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546481  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1955  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  96.77 
 
 
465 aa  872    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233038  normal  0.963876 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  69.16 
 
 
460 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1713  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  52.69 
 
 
465 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  52.15 
 
 
461 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2531  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  53.55 
 
 
461 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603157  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0046  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  51.61 
 
 
460 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0822  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  51.61 
 
 
460 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0660  putative sugar transferase  51.61 
 
 
460 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2514  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  51.61 
 
 
460 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2892  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  51.61 
 
 
460 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2193  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  51.61 
 
 
461 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0646  putative sugar transferase  51.61 
 
 
460 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50 
 
 
471 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.66 
 
 
445 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.52 
 
 
461 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6264  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.84 
 
 
471 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  51.5 
 
 
461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1729  putative sugar transferase  50.75 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00601292  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1089  putative sugar transferase  49.89 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00150658  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3866  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  53.52 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  50 
 
 
475 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2258  putative sugar transferase  50.21 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0307  hypothetical protein  61.69 
 
 
348 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1455  hypothetical protein  61.69 
 
 
348 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1652  hypothetical protein  61.69 
 
 
348 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0274  hypothetical protein  61.41 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209411  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3724  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  49.57 
 
 
458 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.218244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6023  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  50.58 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  0.176572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5835  UDP-sugar lipid carrier transferase  44.44 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  53.75 
 
 
471 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.71 
 
 
468 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.77 
 
 
468 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4149  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.71 
 
 
468 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.71 
 
 
468 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2083  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.85 
 
 
472 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.56 
 
 
467 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2863  sugar transferase  47.38 
 
 
470 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3640  sugar transferase  53.89 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4114  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  53.75 
 
 
472 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4240  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.13 
 
 
462 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.322469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0842  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.19 
 
 
471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.390574  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.96 
 
 
459 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5119  sugar transferase  43.2 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.226358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1698  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.41 
 
 
460 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0279884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  37.34 
 
 
468 aa  322  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0765  putative lipopolysaccharide biosynthesis related protein  40.65 
 
 
450 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.436958  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3176  sugar transferase  42.08 
 
 
456 aa  318  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624901  normal  0.0464887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.56 
 
 
464 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1675  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.48 
 
 
465 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.35 
 
 
464 aa  315  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  38.35 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  38.35 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.35 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.35 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.35 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2228  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.79 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0995309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.35 
 
 
464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2329  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.79 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.0477885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2336  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.79 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0266242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2285  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.79 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.14 
 
 
464 aa  312  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2443  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.56 
 
 
464 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  47.8 
 
 
346 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  39.49 
 
 
466 aa  306  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2026  glycosyltransferase  38.61 
 
 
467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.910937  normal  0.952991 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001326  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsA sugar transferase  38.66 
 
 
466 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0458  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  36.24 
 
 
465 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  38.05 
 
 
464 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1065  polysaccharide biosythesis protein, putative  37.44 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.99 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  33.19 
 
 
484 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.91 
 
 
472 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05207  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.98 
 
 
466 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5211  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  38.06 
 
 
506 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1536  GumD protein  33.91 
 
 
484 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  36.4 
 
 
484 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2715  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.05 
 
 
464 aa  276  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3291  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.66 
 
 
454 aa  276  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2319  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.31 
 
 
496 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1480  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.69 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0810813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3449  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.03 
 
 
469 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0147  polysaccharide biosythesis protein, putative  39.51 
 
 
464 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1807  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.03 
 
 
517 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.3 
 
 
473 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0310  sugar transferase  33.33 
 
 
454 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  37.16 
 
 
473 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  33.55 
 
 
469 aa  269  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.91 
 
 
473 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>