More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2197 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  65.29 
 
 
841 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  73.93 
 
 
844 aa  1071    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  75.46 
 
 
888 aa  1081    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  92.61 
 
 
834 aa  1530    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  73.96 
 
 
839 aa  1073    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  65.44 
 
 
810 aa  923    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  68.65 
 
 
698 aa  953    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  70.46 
 
 
850 aa  1071    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  73.79 
 
 
928 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  72.05 
 
 
821 aa  1161    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  68.27 
 
 
742 aa  966    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  74.28 
 
 
862 aa  1124    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  73.79 
 
 
844 aa  1077    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  66.53 
 
 
732 aa  946    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  73.79 
 
 
844 aa  1077    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  64.09 
 
 
846 aa  912    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  66.48 
 
 
743 aa  972    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  75.52 
 
 
787 aa  1048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  59.04 
 
 
686 aa  782    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  60.49 
 
 
678 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  64.38 
 
 
846 aa  913    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  58.14 
 
 
675 aa  787    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  66.71 
 
 
801 aa  948    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  100 
 
 
838 aa  1702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  73.83 
 
 
858 aa  1116    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  68.49 
 
 
787 aa  960    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  62.04 
 
 
846 aa  940    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  73.96 
 
 
839 aa  1072    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  73.71 
 
 
826 aa  1066    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  68.5 
 
 
743 aa  973    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  68.5 
 
 
743 aa  973    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  73.97 
 
 
857 aa  1103    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  73.86 
 
 
857 aa  1111    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  73.79 
 
 
844 aa  1077    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  74.02 
 
 
870 aa  1110    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  68.12 
 
 
728 aa  937    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  73.97 
 
 
857 aa  1103    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  50.3 
 
 
783 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  39.22 
 
 
743 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  41.27 
 
 
750 aa  465  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  40.52 
 
 
774 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.24 
 
 
850 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  40.75 
 
 
755 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  39.46 
 
 
762 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 
730 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.55 
 
 
760 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  37.37 
 
 
815 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.94 
 
 
752 aa  432  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  38.11 
 
 
740 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.26 
 
 
762 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  34.84 
 
 
786 aa  409  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.02 
 
 
854 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.03 
 
 
794 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.7 
 
 
768 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  37.25 
 
 
767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.85 
 
 
759 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.35 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.8 
 
 
907 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.94 
 
 
765 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.56 
 
 
772 aa  389  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  35.01 
 
 
785 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  34.64 
 
 
773 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.26 
 
 
776 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.7 
 
 
661 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 
809 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  31.75 
 
 
771 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 
819 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 
646 aa  311  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  32.61 
 
 
791 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  32.85 
 
 
817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  31.23 
 
 
777 aa  308  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  32.46 
 
 
797 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.18 
 
 
683 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 
795 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.86 
 
 
648 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.01 
 
 
640 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.65 
 
 
818 aa  293  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.48 
 
 
791 aa  291  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  32.21 
 
 
819 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  32.21 
 
 
819 aa  290  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  32.3 
 
 
819 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.45 
 
 
713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.45 
 
 
713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.45 
 
 
713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  31.33 
 
 
814 aa  288  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 
766 aa  288  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.97 
 
 
714 aa  287  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.7 
 
 
679 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.02 
 
 
705 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 
793 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.68 
 
 
707 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 
713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 
713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  35.91 
 
 
761 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.28 
 
 
748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 
713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  32.43 
 
 
687 aa  283  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  33.39 
 
 
625 aa  282  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.51 
 
 
827 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  31.08 
 
 
810 aa  282  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>