217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2196 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  100 
 
 		 625 aa  1282    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  89.28 
 
 		 623 aa  1152    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  53.67 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  52.27 
 
 		 619 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  47.1 
 
 		 606 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  48.39 
 
 		 609 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  51.32 
 
 		 603 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  48.55 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  49.01 
 
 		 608 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  47.9 
 
 		 612 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  48.63 
 
 		 613 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  46.94 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  46.74 
 
 		 594 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  47.39 
 
 		 613 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  48.29 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  45.79 
 
 		 594 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  42.28 
 
 		 612 aa  475  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  40.68 
 
 		 656 aa  457  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  40.03 
 
 		 624 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  38.68 
 
 		 586 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  37.52 
 
 		 625 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  38.51 
 
 		 595 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  38.14 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  38.49 
 
 		 611 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  38.47 
 
 		 627 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  39.39 
 
 		 621 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  38.5 
 
 		 623 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.02 
 
 		 617 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  37.79 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  39.12 
 
 		 617 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  38.06 
 
 		 605 aa  369  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  38.67 
 
 		 596 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2935  glycoside hydrolase 15-related protein  39.35 
 
 		 617 aa  363  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  38.56 
 
 		 602 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  37.83 
 
 		 600 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  39.5 
 
 		 602 aa  362  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  37.96 
 
 		 645 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  38.53 
 
 		 602 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  38.4 
 
 		 619 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  38.93 
 
 		 621 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  38.36 
 
 		 602 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  37.79 
 
 		 614 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  38.37 
 
 		 623 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  37.1 
 
 		 597 aa  359  9e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  37.29 
 
 		 617 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  38.27 
 
 		 627 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  38.11 
 
 		 627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  37.02 
 
 		 601 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  36.35 
 
 		 636 aa  357  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  38.32 
 
 		 596 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  37.89 
 
 		 626 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  37.58 
 
 		 613 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  37.86 
 
 		 600 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  37.34 
 
 		 894 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  36.25 
 
 		 611 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  37.93 
 
 		 603 aa  353  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  36.96 
 
 		 600 aa  353  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  36.99 
 
 		 679 aa  352  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  36.79 
 
 		 611 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  37.05 
 
 		 609 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  37.12 
 
 		 609 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  36.87 
 
 		 665 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  37.54 
 
 		 609 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  37.27 
 
 		 593 aa  350  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  36.67 
 
 		 602 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  36.1 
 
 		 612 aa  349  8e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 		 619 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  37.77 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.63 
 
 		 609 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.63 
 
 		 609 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  36.54 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  36.04 
 
 		 636 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  37.48 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  37.02 
 
 		 601 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  35.35 
 
 		 642 aa  347  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  37.81 
 
 		 616 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  35.45 
 
 		 668 aa  346  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  35.54 
 
 		 627 aa  346  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.47 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  36.84 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  36.35 
 
 		 594 aa  345  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  36.86 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  36.3 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  34.55 
 
 		 672 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  36.68 
 
 		 610 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  37.34 
 
 		 620 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  36.83 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  36.26 
 
 		 608 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  36.88 
 
 		 869 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  36.3 
 
 		 629 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  36.04 
 
 		 635 aa  340  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  34.8 
 
 		 677 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  34.8 
 
 		 677 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  36.14 
 
 		 868 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>