More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2183 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  100 
 
 		 338 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  79.06 
 
 		 342 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  79 
 
 		 346 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  69.94 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  54.91 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  58.41 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  58.1 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  60.19 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  59.24 
 
 		 352 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  54.63 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  58.92 
 
 		 353 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  57.83 
 
 		 370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  54.52 
 
 		 372 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  54.19 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  40.45 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  42.99 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  41.21 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  39.68 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  49.31 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  39.5 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  40.06 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  44.83 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  47.41 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  45.53 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  38.78 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  37.54 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  37.89 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  38.44 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.74 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  38.78 
 
 		 314 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  41.03 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.43 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.48 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  35.71 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  39.69 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  35.96 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  35.67 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  37.17 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  36.56 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28.33 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  32.46 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  32.02 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  35.98 
 
 		 435 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.06 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.82 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  38.12 
 
 		 244 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.98 
 
 		 261 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  31.66 
 
 		 313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  30.35 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  37.83 
 
 		 235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  36.73 
 
 		 189 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  27.95 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.05 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.01 
 
 		 401 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  30.94 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  36.41 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  34.35 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  29.03 
 
 		 380 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.3 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.32 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 		 374 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  33.93 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.33 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.48 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.61 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  29.08 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  25.65 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  34.34 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  26.46 
 
 		 524 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  30.81 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  28.29 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  27.61 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  27.61 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>