More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2161 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  100 
 
 		 514 aa  1013    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  68.02 
 
 		 496 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  92.79 
 
 		 499 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  67.21 
 
 		 493 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  53.78 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  53.78 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  53.26 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  52.31 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  52.1 
 
 		 489 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  52.1 
 
 		 489 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  51.89 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  31.49 
 
 		 454 aa  237  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  30 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 478 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  30.92 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 471 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.44 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  28 
 
 		 480 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.27 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  28.35 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.6 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 477 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.34 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  28.22 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.36 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  29.52 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  29.67 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.64 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 508 aa  107  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.55 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  28.32 
 
 		 494 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 442 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 447 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.41 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  26.84 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.17 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.45 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.68 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 484 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  29.09 
 
 		 458 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 480 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  29.09 
 
 		 458 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 474 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.18 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.3 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.3 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  26.72 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  30.03 
 
 		 514 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.18 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.18 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 479 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.94 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.94 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.44 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 494 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  28.61 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  25.88 
 
 		 468 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 460 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 453 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 474 aa  94  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 443 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 443 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.88 
 
 		 443 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 443 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>