290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2153 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  91.67 
 
 		 276 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  50.36 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  50.55 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  49.26 
 
 		 276 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  43.4 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  43.18 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  43.18 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  43.18 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  42.64 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  41.91 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  41.54 
 
 		 273 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  41.91 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  41.18 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  32.6 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  31.58 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.51 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  39.88 
 
 		 366 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  26.74 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  35.17 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 		 1001 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  25.85 
 
 		 373 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  36.63 
 
 		 383 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  29.15 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.46 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.46 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.2 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 1015 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  29.06 
 
 		 437 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  29.06 
 
 		 395 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  29.06 
 
 		 378 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  29.06 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  29.06 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  29.06 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 224 aa  86.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 373 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 		 437 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 366 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.52 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 401 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.97 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  31.37 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  27.47 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  26.64 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  23.38 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 645 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.08 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  24.83 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 548 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 548 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  26.25 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  24.44 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.08 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  27.51 
 
 		 684 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  29.55 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  29.7 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>